Effects of FADS and ELOVL polymorphisms on indexes of desaturase and elongase activities: results from a pre-post fish oil supplementation

Cormier, Hubert; Rudkowska, Iwona; Lemieux, Simone; Couture, Patrick; Julien, Pierre; Vohl, Marie-Claude

doi:10.1007/s12263-014-0437-z

Table 3 Linkage disequilibrium (R ²) of the tagging SNPs within the FADS gene cluster

From: Effects of FADS and ELOVL polymorphisms on indexes of desaturase and elongase activities: results from a pre-post fish oil supplementation

	rs174546	rs12807005	rs968567	rs174570	rs2845573	rs2072114	rs174579	rs7935946	rs174602	rs498793	rs174611	rs174616	rs482548	rs174627	rs174448	rs7482316	rs7942717	rs7394871	rs174456
rs174546		0.016	0.424	0.304	0.159	0.223	0.568	0.054	0.229	0.04	0.452	0.287	0.047	0.232	0.363	0.067	0.021	0.037	0.222
rs12807005	0.016		0.007	0.005	0.003	0.004	0.01	0.001	0.007	0.02	0.003	0.001	0.029	0	0.004	0.003	0.002	0.002	0.001
rs968567	0.424	0.007		0.038	0.02	0.014	0.636	0	0.02	0.038	0.351	0.204	0.02	0.486	0.261	0.009	0.002	0.012	0.292
rs174570	0.304	0.005	0.038		0.522	0.345	0.028	0.005	0.1	0.01	0.033	0.035	0.014	0.013	0.037	0.124	0.008	0.177	0.001
rs2845573	0.159	0.003	0.02	0.522		0.714	0.029	0.003	0.021	0.03	0.026	0.016	0	0.008	0.015	0.154	0.007	0.357	0.002
rs2072114	0.223	0.004	0.014	0.345	0.714		0.04	0.242	0.004	0.001	0.036	0.031	0.008	0.006	0.037	0.191	0.018	0.249	0
rs174579	0.568	0.01	0.636	0.028	0.029	0.04		0.01	0.203	0.025	0.34	0.227	0.029	0.371	0.312	0.001	0.004	0.018	0.292
rs7935946	0.054	0.001	0	0.005	0.003	0.242	0.01		0.066	0.019	0.008	0.014	0.003	0	0.022	0.031	0.011	0.002	0.002
rs174602	0.229	0.007	0.02	0.1	0.021	0.004	0.203	0.066		0.002	0.11	0.123	0.021	0.005	0.199	0.094	0.085	0.013	0.034
rs498793	0.04	0.02	0.038	0.01	0.03	0.001	0.025	0.019	0.002		0.109	0.121	0.033	0.033	0.049	0.025	0.002	0.017	0.022
rs174611	0.452	0.003	0.351	0.033	0.026	0.036	0.34	0.008	0.11	0.109		0.622	0.046	0.475	0.729	0.202	0.014	0.066	0.342
rs174616	0.287	0.001	0.204	0.035	0.016	0.031	0.227	0.014	0.123	0.121	0.622		0.068	0.323	0.68	0.125	0.043	0.035	0.369
rs482548	0.047	0.029	0.02	0.014	0	0.008	0.029	0.003	0.021	0.033	0.046	0.068		0.024	0.053	0.009	0.004	0.005	0.032
rs174627	0.232	0	0.486	0.013	0.008	0.006	0.371	0	0.005	0.033	0.475	0.323	0.024		0.408	0.029	0.017	0.001	0.484
rs174448	0.363	0.004	0.261	0.037	0.015	0.037	0.312	0.022	0.199	0.049	0.729	0.68	0.053	0.408		0.174	0.098	0.053	0.568
rs7482316	0.067	0.003	0.009	0.124	0.154	0.191	0.001	0.031	0.094	0.025	0.202	0.125	0.009	0.029	0.174		0	0.283	0.02
rs7942717	0.021	0.002	0.002	0.008	0.007	0.018	0.004	0.011	0.085	0.002	0.014	0.043	0.004	0.017	0.098	0		0.003	0.161
rs7394871	0.037	0.002	0.012	0.177	0.357	0.249	0.018	0.002	0.013	0.017	0.066	0.035	0.005	0.001	0.053	0.283	0.003		0.02
rs174456	0.222	0.001	0.292	0.001	0.002	0	0.292	0.002	0.034	0.022	0.342	0.369	0.032	0.484	0.568	0.02	0.161	0.02

Back to article page

ISSN: 1865-3499

Contact us

General enquiries: journalsubmissions@springernature.com

Genes & Nutrition

Contact us