Table 1 Pyrosequencing amplicons and sequencing primers
Gene | Amplicon | Sequencing primer | ||
|---|---|---|---|---|
Mouse RXRA | RXRA A 1–4 60 °C | F: GGTTGTGAGGGGGTAGAATTA R: CCCCACAAACCTTTCCTAATCC | RXRA A 1 s RXRA A 2–3 s RXRA A 4 s | GAGATTATAAGTTTTATTTTAGGGA TGTTTTTTAAATTTTTGGGTTATT TGAAATTTGGGTTGTAGAT |
RXRA B 1–6 57 °C | F: AGAGGGGTTTATTAAAGTTTATAGGT R: AATTTCTCTATATAACCCTAACTATCCT | RXRA B 1–2 s RXRA B 3–4 s RXRA B 5–6 s | TTTTAAGATAAAAAAGAAAGT TTTTTTTTGTAAAAAGTAATAGT TGGTGGTATAAGTTTTTAATATTAG | |
Mouse Runx2 | Runx2 24–28 57 °C | F: ATGGAGTGGTGGTAATTAAATAGT R: ATAACTTACTTTCATTACCCCTCATT | Runx2 25–24 S Runx2 26 S Runx2 27 S Runx2 28 S | GGGAGGAGAATAAAATATTTTT GGGAGTTTTTATTTGAAATATG GGTTTTTAAGATAGGATTTTTTATA AGTGGTGGTAATTAAATAGTA |
Mouse Osterix | Osterix 8–18 54 °C | F: GTTTTTATGTGGGTAGTAGAGAGT R: ATCCAATCCTACAATCCTACTCTTAA | Osx 11–8 S Osx 17 S Osx 19–18 S | AGTAGTAGTAGTAGTAGTAATAGA GTTTTAGTTTTTTTGTGTGAG ATGTGGGTAGTAGAGAGTA |
Mouse VDR | VDR 1–6 57 °C | F: TGTTATATTATTTAATTTTGTAGGGGGTAG R: CCTCATAAAAACCAACTTACTTACTCT | VDR 1–2 S VDR 3–5 S VDR 6 S | TTTAGTTAAGTGGAGATAAAATTAG AGTGAGTTTTGGGTG AAGATTTTTAGAGAGAGGTA |
VDR 8–10 60 °C | F: GGTGTGGTTTTTGTTAAAGAATATTAAGA R: CACTCCCAAATTTCTAAACTAACCTTAA | VDR 8 S VDR 9 S VDR 10 s | AGTTAAGTGATTATTGGTAATAT GGTGTTATAGTAATTTTTGTGTAT AGGATTTGGAATTGTAAATG | |