Table 1 The specific primers used for the PCR amplification
Gene | Forward and reverse primers | bp | Annealing temperature (°C) |
|---|---|---|---|
Clock | 5′-TTCGACAGGACTGGAAACCC-3′ 5′-GTTCTCCCTCTGGGATAAAA-3′ | 201 | 56 |
Bmal1 | 5′-GCAGTGCCACTGACTACCAGTT-3′ 5′-TGTGCTGAACAGCCATCCTTAG-3′ | 207 | 55 |
Per1 | 5′-GGGAGCTCAAACTTCGACTG-3′ 5′-GAGACCTGAACCTGCAGAGG-3′ | 437 | 60 |
Per2 | 5′-GTGAAGCAGGTGAAGGCTAAT-3′ 5′-AAGCTTGTAAGGGGTGGTGTAG-3′ | 312 | 58 |
Cry1 | 5′-TTCGGGGACAGCCAGCTGAT-3′ 5′-TCTCCTCCTGGCCACACTGCAGA-3′ | 421 | 60 |
Cry2 | 5′-GGCAGAAACCACCCCTTA-3′ 5′-CCAGGGAAGGCACGCCAT-3′ | 159 | 53 |
PPARα | 5′-CCTGGAAAGTCCCTTATCT-3′ 5′-GCATTTGTTCCGGTTCTTC-3′ | 412 | 58 |
CYP7A1 | 5′-CCTTGGGACGTTTTCCTGCT-3′ 5′-GCGCTCTTTGATTTAGGAAG-3′ | 515 | 56 |
HMGCR | 5′-GAATGCCTTGTGATTGGAGTTG-3′ 5′-ACACAGGCCGGGAAGAATG-3′ | 125 | 54 |
LDLR | 5′-GTGTGAACCTGGAAGGCAGCTA-3′ 5′-TCTGTCCAGTAGATGTTGCGGT-3′ | 375 | 52 |
LPL | 5′-TCAGAGCCAAGAGAAGCAGCAA-3′ 5′-TTGTGTTGCTTGCCATCCTCA-3′ | 118 | 58 |
DGAT | 5′-GTGCACAAGTGGTGCATCA-3′ 5′-CAGTGGGACCTGAGCCATC-3′ | 180 | 58 |
FAS | 5′-AGGGGTCGACCTGGTCCTCA-3′ 5′-GCCATGCCCAGAGGGTGGTT-3′ | 132 | 60 |
GAPDH | 5′-GTATGACGTGGAGTCTACTG-3′ 5′-TACTCCTTGGAGGCCATGTA-3′ | 728 | 56 |